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El universo Metroid (メトロイド Metoroido) se refiere a la colección en la serie Super Smash Bros. de personajes, escenarios, y propiedades que provienen de la famosa serie de juegos de aventura y ciencia ficción Metroid de Nintendo, siendo una de sus franquicias más exitosas. La serie tiene 11 juegos lanzados hasta ahora, la mayoría siendo alabados por criticos y jugadores por igual. La serie también tiene una compilación (Metroid Prime Trilogy) y dos "remakes" mejorados (New Play Control! Metroid Prime y New Play Control! Metroid Prime 2: Echoes). La serie gira en torno a las misiones espaciales de una mujer cazarrecompensas llamada Samus Aran.
En un principio, los juegos de esta saga eran de desplazamiento lateral, creyendo en un primer momento que el protagonista era un cyborg masculino, dotado de superpoderes por medio de un traje especial, pero cuando los jugadores terminaban el juego de NES al 75% o más, Samus se quitaba el casco, dejando entrever que era una mujer, y si se completaba el juego al 95% o más, se quedaba en traje de baño, lo cual dio a muchas especulaciones. Shigeru Miyamoto explicó este acontecimiento, diciendo que la idea de que Samus fuera una mujer fue concebida, en un principio, como una idea disparatada, para dar una última sorpresa a los fans de la saga, "obligándolos a hacerse con un porcentaje de objetos determinado", lo cual se llevó a cabo y ha hecho que la saga gane en adeptos. Así fue hasta el año 2002 (pasando por Metroid II: Return of Samus, para Game Boy, y Super Metroid, para Super Nintendo), en el que coincidieron los lanzamientos de Metroid Fusion para Game Boy Advance (plataformas y disparos al estilo clásico de la saga), y poco después seguido por el primer Metroid Prime para Nintendo GameCube, el cual dió un vuelco a la saga, haciéndola un shooter de acción en primera persona, siendo uno de los primeros juegos así, ganando exploración y profundidad, aunque perdiendo algo la esencia. Tuvo mucho éxito, ya que dos años después fue lanzado Metroid Prime 2: Echoes también para GameCube, en el cual mejoraban tanto los gráficos como la dificultad, ya que ahora eran dos planetas a explorar en vez de uno. Ese mismo año, se lanzó para Game Boy Advance un remake del primer juego de la saga, al que bautizaron como Metroid: Zero Mission, el cual contenía el juego original de NES. En el año 2005, con el lanzamiento de Nintendo DS, Nintendo hacía un paréntesis en los acontecimientos de las otras dos entregas con una especial: Metroid Prime Hunters, la cual luego se dijo que no tenía nada que ver en el desarrollo de la historia original. En el año 2007, Nintendo anunció que la trilogía Prime se cerraba con el lanzamiento de Metroid Prime 3: Corruption, el cual fué lanzado para Nintendo Wii, aprovechando las funciones de la consola. Aquí eran muchos más planetas por visitar, además de nuevas funciones, que trajeron de vuelta las dos primeras entregas remasterizadas para Wii en una entrega para coleccionistas: Metroid Prime Trilogy, la cual traía los tres Prime con los controles de Wii. Por último, en el año 2010, Metroid volvía a sus orígenes de desplazamiento en tercera persona, en forma de Metroid: Other M, el cual mezclaba shooter y plataformas, que pone el punto y seguido a una de las máximas cumbres para el cerebro de Miyamoto. Luego se pueden nombrar otros juegos de la saga, pero que no tienen apenas que ver con ellas, como Metroid Prime: Pinball (DS).